Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms