Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms