Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms