Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms