Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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