Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms