Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMF1P82094 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMF1P82094 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMF1P82094 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMF1P82094 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMF1P82094 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMF1P82094 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMF1P82094 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMF1P82094 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms