Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms