Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A2P52657 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms