Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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