Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms