Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms