Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PRG2P13727 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms