Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BMP3P12645 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BMP3P12645 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BMP3P12645 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BMP3P12645 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP3P12645 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP3P12645 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP3P12645 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP3P12645 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP3P12645 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP3P12645 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms