Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LNPKQ9C0E8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms