Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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