Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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