Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms