Protein–RNA interactions for Protein: P46976

GYG1, Glycogenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYG1P46976 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GYG1P46976 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GYG1P46976 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GYG1P46976 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GYG1P46976 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GYG1P46976 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GYG1P46976 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GYG1P46976 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GYG1P46976 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GYG1P46976 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GYG1P46976 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GYG1P46976 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
GYG1P46976 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GYG1P46976 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GYG1P46976 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GYG1P46976 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GYG1P46976 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GYG1P46976 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GYG1P46976 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms