Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms