Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG7O95352 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms