Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CFAP69A5D8W1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP69A5D8W1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP69A5D8W1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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