Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYY5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYY5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYY5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYY5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYY5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYY5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYY5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYY5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYY5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYY5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYY5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYY5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYY5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYY5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYY5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYY5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYY5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYY5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYY5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
V9GYY5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
V9GYY5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYY5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYY5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYY5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYY5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYY5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYY5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYY5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYY5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYY5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYY5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYY5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYY5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYY5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYY5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYY5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYY5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYY5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYY5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYY5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYY5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYY5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYY5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYY5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYY5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYY5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYY5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYY5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYY5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYY5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYY5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYY5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYY5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYY5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYY5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYY5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYY5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYY5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYY5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYY5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYY5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYY5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYY5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
V9GYY5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
V9GYY5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
V9GYY5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
V9GYY5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms