Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF3AQ9Y496 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms