Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHOC2Q9UQ13 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHOC2Q9UQ13 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
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