Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLA2G4CQ9UP65 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4CQ9UP65 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLA2G4CQ9UP65 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms