Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPG21Q9NZD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms