Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 VAC14-211ENST00000568886 2151 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.194e-7■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 PIGG-211ENST00000506402 2387 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.185e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 ZFYVE21-210ENST00000556610 364 ntTSL 515.99■□□□□ 0.157e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 515.87■□□□□ 0.137e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.127e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 ZFYVE21-206ENST00000554630 566 ntTSL 215.68■□□□□ 0.17e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.094e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.097e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.077e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.057e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.057e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.037e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TNK2-214ENST00000464041 3545 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.017e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 VAC14-206ENST00000564685 892 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.024e-7■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 IGF2BP1-206ENST00000515586 768 ntTSL 314.78□□□□□ -0.047e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.087e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.115e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-227ENST00000575714 2978 ntTSL 514.34□□□□□ -0.117e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 314.28□□□□□ -0.127e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CABLES1-210ENST00000585061 584 ntTSL 514.16□□□□□ -0.147e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 KRTAP5-AS1-203ENST00000532922 519 ntTSL 414.12□□□□□ -0.157e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.155e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 313.94□□□□□ -0.184e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 DOT1L-205ENST00000478937 638 ntTSL 313.73□□□□□ -0.217e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.217e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.227e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.257e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.267e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 AL132656.4-201ENST00000623504 2122 ntBASIC13.41□□□□□ -0.267e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 AC004951.1-201ENST00000447643 1866 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 PIGG-215ENST00000508562 570 ntTSL 413.34□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.297e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.37e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-208ENST00000571227 3578 ntTSL 513.15□□□□□ -0.37e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.327e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.347e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)12.81□□□□□ -0.367e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 IGF2BP1-203ENST00000499130 568 ntTSL 312.79□□□□□ -0.367e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 212.63□□□□□ -0.397e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.397e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.487e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 NPC1L1-202ENST00000381160 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.57e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.517e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CABLES1-205ENST00000579963 2074 ntTSL 211.77□□□□□ -0.527e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.537e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.747e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.797e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CABLES1-203ENST00000420687 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.857e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 VAC14-207ENST00000566416 780 ntTSL 39.68□□□□□ -0.864e-7■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 USP4-213ENST00000488520 1155 ntTSL 38.98□□□□□ -0.977e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CABLES1-202ENST00000400473 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.997e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 36.11□□□□□ -1.437e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.487e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 RSRP1-219ENST00000568701 629 ntAPPRIS ALT2 TSL 417.67■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 RSRP1-203ENST00000450820 970 ntTSL 29.14□□□□□ -0.951e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 517.05■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.325e-8■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 421.73■■□□□ 1.075e-8■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 321.73■■□□□ 1.075e-8■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 318.4■□□□□ 0.545e-8■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 517.39■□□□□ 0.375e-8■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 217.24■□□□□ 0.355e-8■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.187e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-204ENST00000439280 1021 ntTSL 318.27■□□□□ 0.523e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.423e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 MIR210HG-202ENST00000528245 659 ntTSL 316.62■□□□□ 0.257e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.257e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 MIR210HG-204ENST00000534540 367 ntTSL 214.87□□□□□ -0.037e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-207ENST00000465331 583 ntTSL 314.53□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-211ENST00000524825 550 ntTSL 413.32□□□□□ -0.283e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-213ENST00000527330 564 ntTSL 413.32□□□□□ -0.283e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-212ENST00000526890 5732 ntTSL 213.17□□□□□ -0.33e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 CARS-215ENST00000531387 2805 ntTSL 211.38□□□□□ -0.593e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 SLC16A3-218ENST00000583444 2882 nt20.48■□□□□ 0.872e-12■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 421.85■■□□□ 1.095e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 GAK-219ENST00000512325 577 ntTSL 321.85■■□□□ 1.095e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 521.8■■□□□ 1.085e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 420.17■□□□□ 0.825e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 GAK-212ENST00000510022 618 ntTSL 410.49□□□□□ -0.735e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 GAK-215ENST00000511229 568 ntTSL 36.42□□□□□ -1.385e-7■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.153e-6■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 SGTA-204ENST00000589251 637 ntTSL 313.61□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 IFT140-206ENST00000565298 4727 ntTSL 220.68■□□□□ 0.97e-9■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.527e-9■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 IFT140-202ENST00000397417 4023 ntTSL 511.69□□□□□ -0.547e-9■■■■□ 21.8
SLTMQ9NWH9 AP006621.3-201ENST00000526588 291 ntTSL 221.11■□□□□ 0.975e-7■■■■□ 21.7
SLTMQ9NWH9 AP002495.1-202ENST00000528511 933 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.69e-7■■■■□ 21.7
SLTMQ9NWH9 AP002495.1-201ENST00000532852 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.83□□□□□ -1.329e-7■■■■□ 21.7
SLTMQ9NWH9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.568e-7■■■■□ 21.7
SLTMQ9NWH9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 21.7
SLTMQ9NWH9 TBL1X-208ENST00000452824 387 ntTSL 511.92□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 21.7
SLTMQ9NWH9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-7■■■■□ 21.7
SLTMQ9NWH9 CFLAR-211ENST00000439154 1310 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.331e-7■■■■□ 21.7
SLTMQ9NWH9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 21.7
SLTMQ9NWH9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 21.7
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