Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT13Q9NUP7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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