Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A7

RMI1, RecQ-mediated genome instability protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI1Q9H9A7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RMI1Q9H9A7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMI1Q9H9A7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms