Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPEF2Q9C093 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPEF2Q9C093 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms