Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC39A3Q9BRY0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms