Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINFPQ9BQA5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINFPQ9BQA5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HINFPQ9BQA5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms