Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCF25Q9BQ70 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF25Q9BQ70 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms