Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP4Q99569 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms