Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
STAC3Q96MF2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
STAC3Q96MF2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
STAC3Q96MF2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
STAC3Q96MF2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
STAC3Q96MF2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms