Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDK5RAP3Q96JB5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms