Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC12Q96J65 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC12Q96J65 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms