Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM17Q96I25 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms