Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SGSM3Q96HU1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms