Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTV1Q96GA3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms