Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
P3H4Q92791 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms