Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL2Q8NHH9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms