Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE6

FBXL13, F-box/LRR-repeat protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL13Q8NEE6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXL13Q8NEE6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXL13Q8NEE6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXL13Q8NEE6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXL13Q8NEE6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXL13Q8NEE6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXL13Q8NEE6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXL13Q8NEE6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms