Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF1

GLIS1, Zinc finger protein GLIS1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1Q8NBF1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIS1Q8NBF1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIS1Q8NBF1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLIS1Q8NBF1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms