Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD1Q8N9Z9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms