Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
VWDEQ8N2E2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
VWDEQ8N2E2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms