Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPBP1Q86WP2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPBP1Q86WP2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms