Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIBP1Q86W92 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms