Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMC4Q7Z404 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMC4Q7Z404 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms